Σύμφωνα λοιπόν με την επιγραφή της λειψανοθήκης ο ναός ήταν αφιερωμένος στην Παναγία. Ο ναός χτίστηκε μετά το 1340 συμπέρασμα που εξάγεται από ένα νόμισμα του 1340 που βράθηκε στην τοιχοποιία του τρούλου.
Ο ναός στη σημερινή του μορφή είναι μικρός και τετράγωνος με τρείς κόγχες (τρίκογχος): ανατολικά (ιερό), βόρεια και νότια. Από τις έρευνες των αρχαιολόγων διαπιστώθηκε ότι στα βυζαντινά χρόνια ο ναός είχε και τέταρτη κόγχη στη δυτική πλευρά του ναού επομένως ο ναός ήταν τετράκογχος. Το ιδιόμορφο σχήμα του ναού καθώς και δύο ταφές που βρέθηκαν στη βόρεια και στη νότια κόγχη δείχνουν ότι ο ναός ήταν ταφικό κτίσμα.
Ο ναός στο σύνολό του ήταν αγιοηραφημένος. Σώζεται η τοιχογράφηση του τρούλου με την παράσταση της Αναλήψεως στην επάνω ζώνη, τους προφήτες στη μεσαία και τη θεία λειτουργία στην κατώτερη ζώνη.
